Состоит из двух дивизионов: J. League Дивизион 1 и J. League Дивизион 2.
«Джей Лига» начала свою деятельность в 1993 году как профессиональная лига из 10 команд. С 1999 года она приняла систему двух дивизионов: в настоящее время в каждом дивизионе играют 18 команд. Таким образом, всего под флагом «Джей Лиги» соревнуются 36 команд. Команды встречаются в матчах чемпионата лиги и в кубковом турнире. Матчи между командами одного дивизиона проходят по круговой системе: все команды встречаются друг с другом у себя на поле и на поле противника.

Встречи команд J1 проходят в два круга- с марта по декабрь. Чемпион года определяется по количеству очков, набранных командами.

В розыгрыше кубка принимают участие все команды J1 и J2. Матчи первого круга и все матчи вплоть до полуфинальных проводятся на нейтральном поле. Финал — это только один матч, в котором и определяется обладатель кубка. После того как станут известны окончательные результаты за год, на следующий год три команды J1, находящиеся внизу таблицы, автоматически выбывают в J2, и им на смену приходят три лучшие команды J2.

В розыгрыше кубка принимают участие все команды J1 и J2. Все матчи розыгрыша Кубка Императора Японии проходят на нейтральных полях. Финал традиционно проводится 1 января на «Токийском национальном стадионе».

Каждому клубу разрешено иметь в своём составе не более пяти легионеров из других стран. На поле в составе одной команды могут одновременно находится 3 иностранца, плюс 1 игрок из страны АФК. Когда «Джей Лиг» только образовалась, клубы подписали контракты с некоторыми из самых известных футболистов мира: «Касима Антлерс», например, пригласили бразильца Зико, а «Джеф Юнайтед Итихара» — футболиста из Германии Пьера Литтбарски. Эти иностранные таланты оправдали возлагавшиеся на них надежды, приводя болельщиков в восхищение своим мастерством мирового класса. Они немало содействовали взлёту популярности «Джей Лиги» и оказали мощное влияние на японских футболистов, способствуя существенному улучшению техники их игры.

Клуб, желающий быть членом «Джей Лиги», должен отвечать определённым требованиям. Кроме основного состава каждый клуб Джей-1 должен иметь дубль (для подготовки игроков) и три любительские команды юниоров: молодёжную, в которой играют игроки не старше 18 лет, юношескую, для ребят не старше 15 лет, и детскую, для тех, кто не старше 12. Условия, предъявляемые к клубам Джей-2, аналогичны, за исключением того, что иметь команды для ребят до 15 лет и до 12 лет необязательно. Клубы Джей-1 должны иметь возможность играть на стадионе, рассчитанном не менее чем на 15 000 зрителей, для клубов Джей-2 нужен стадион не менее чем на 10 000 мест, и тем и другим требуются клубные помещения с определённым количеством полей с травяным покрытием.

Чтобы отвечать этим требованиям, каждый клуб регистрируется как юридическое лицо, и нередко компании, местные органы управления и другие субъекты деятельности имеют свою долю в акциях этих корпораций. Значительная доля клубных средств поступает от спонсоров, например, от компаний, которые платят за рекламу их названий на спортивной форме.